Lemmikin tunnistusmerkintä tapahtuu asettamalla mikrosiru nahan alle, yleisimmin selkäpuolelle lapojen väliin. Mikrosirussa on yksilöllinen numerotunniste, joka voidaan lukea sirunlukijalla. Numerotunniste toimii ikään kuin lemmikin henkilötunnuksena.
Mikrosiru voidaan asettaa esimerkiksi pentutarkastuksen tai rokotusten yhteydessä.
Koira voidaan rekisteröidä Koirarekisteriin (viranomaisrekisteri) ja Kennelliiton rekisteriin. Kissat voidaan rekisteröidä Kissaliiton rekisteriin. Näiden lisäksi lemmikki kannattaa rekisteröidä Turvasiru- tai siruhaku.fi-palveluihin, joiden avulla lemmikki voidaan tunnistaa ja omistajaan ottaa yhteyttä esimerkiksi sen kadotessa.